Je suis chercheur à l'INRAE depuis 1983, directeur de recherche depuis 2002. J'ai été directeur adjoint de l'unité Micalis et directeur scientifique de MetaGenoPolis. Pendant plus de 40 ans, j'ai étudié l'écosystème microbien intestinal, ces milliers de milliards de bactéries qui vivent en nous et influencent notre santé bien au-delà de la digestion.
S'appuyant sur la métagénomique, mon travail vise à comprendre les relations alimentation-microbiote-santé, et comment les mobiliser au service de la nutrition préventive et la médecine de précision de l'humain-microbien.
"Nous sommes ce que nos microbes intestinaux font avec ce que nous mangeons. Comprendre notre écosystème intestinal, c'est comprendre une part essentielle de qui nous sommes."
Depuis des millions d'années, l'être humain vit en symbiose avec ses microbes. Cet équilibre est inscrit dans notre biologie. Mais lorsqu'il se rompt (on parle alors de symbiose altérée), les conséquences peuvent être profondes et durables, augmentant le risque de troubles et maladies chroniques : maladies inflammatoires ou métaboliques, allergies, troubles neuropsychiatriques…
Mon travail a consisté à cartographier ces communautés microbiennes, comprendre comment elles influencent notre santé, et identifier les leviers pour protéger, et restaurer cet équilibre quand il se dérègle.
Durant plus de 40 ans, j'ai porté et été associé à des travaux de recherches publiés dans les plus grandes revues scientifiques internationales. Ce sont plus de 300 articles, parmi les plus cités au monde dans le domaine du microbiote intestinal.
Voir les publications →Je parle régulièrement du microbiote dans les médias, parce que cette science mérite d'être comprise par tous, pas seulement par les chercheurs.
Voir les médias →Entrée à l'Institut National de la Recherche Agronomique, début des travaux sur l'écologie microbienne intestinale animale.
Thèse de doctorat à Urbana-Champaign (USA) en écologie microbienne du rumen.
Co-fondateur d'Enterome, startup en biotechnologie ciblant le microbiome pour les maladies inflammatoires et le cancer.
Nommé directeur scientifique de MetaGenoPolis, plateforme d'excellence en métagénomique quantitative et fonctionnelle du microbiote intestinal.
Implication dans la création de MaaT Pharma : restauration de l'écosystème intestinal par transfert de microbiote chez des patients souffrant de complications sévères du traitement de cancers du sang.
Co-fondateur de GMT Science (analyse standardisée du microbiote de qualité clinique) et de NovoBiome (modèles d'intestin sur puce et microbiote de synthèse pour le design de suppléments fonctionnels).
Accompagnement de Winbiota (Mativa Tech Iberica) : mise au service du grand public des connaissances sur le microbiote, du bilan à l'accompagnement nutritionnel.
Lancement du French Gut : cartographie du microbiote de 100 000 Français.
Président du World Microbiome Partnership, alliance internationale pour le microbiote en santé humaine, animale, végétale et planétaire.